Η αμνιοπαρακέντηση είναι η πιο παλιά επεμβατική εξέταση, που σκοπό έχει τη διάγνωση γενετικών νοσημάτων και διαφόρων παθήσεων. Η εξέταση αυτή πραγματοποιείται μετά από τη 16η εβδομάδα της κύησης. Η λήψη του αμνιακού υγρού γίνεται με μια λεπτή βελόνη από την κοιλιά, υπό συνεχή υπερηχογραφικό έλεγχο.

Όλη η διαδικασία είναι ανώδυνη και ολοκληρώνεται σε λίγα δευτερόλεπτα. Ο κίνδυνος αποβολής είναι περίπου 0,5% (1/200), δεν υπάρχει ουσιαστικός κίνδυνος τραυματισμού του εμβρύου και ο κίνδυνος για την έγκυο είναι αμελητέος.

Η βιοψία τροφοβλάστης είναι νεότερη μέθοδος λήψης εμβρυϊκών κυττάρων και πραγματοποιείται από την 11η μέχρι και την 13η εβδομάδα της κύησης. Η λήψη γίνεται από τον πλακούντα με μια λεπτή βελόνη διάμεσου της κοιλιάς υπό συνεχή υπερηχογραφικό έλεγχο.

Το πλεονέκτημα της μεθόδου είναι ότι γίνεται νωρίς στην κύηση και σε περίπτωση προβλήματος του εμβρύου, η διακοπή της κύησης είναι ευκολότερη, ενώ αντίθετα μετά την αμνιοπαρακέντηση προκαλείται τοκετός. Επιπλέον δε, ελαττώνει την ψυχολογική επιβάρυνση του ζευγαριού γνωρίζοντας το αποτέλεσμα νωρίτερα.