Η εγκεφαλική παράλυση είναι πάθηση του Κεντρικού Νευρικού Συστήματος που μπορεί να προέρχεται από πολλές άγνωστες αιτίες και σύνδρομα. Ο μοριακός καρυότυπος χαμηλής ανάλυσης, που χρησιμοποιείται στην αμνιοπαρακέντηση, μπορεί να διαγνώσει μόνο καρυοτυπικές ανωμαλίες, εκ των οποίων μερικές απ αυτές μπορεί να περιλαμβάνουν στη συμπτωματολογία τους και την εγκεφαλική παράλυση.