Τη βιοψία τροφοβλάστης, γιατί γίνεται νωρίτερα και σε περίπτωση πάσχοντος εμβρύου η διακοπή γίνεται με απόξεση. Ακόμα, η ψυχολογική επιβάρυνση είναι μικρότερη, επειδή τα αποτελέσματα γίνονται άμεσα γνωστά. Η αμνιοπαρακέντηση, αντίστοιχα, γίνεται από την 16η μέχρι την 24η εβδομάδα της κύησης και σε περίπτωση ανωμαλίας, η διακοπή γίνεται με πρόκληση τοκετού. Το πλεονέκτημα της αμνιοπαρακέντησης είναι ο μικρότερος κίνδυνος αποβολής, χωρίς να διαφέρει πολύ απ’ αυτόν της βιοψίας.